Am 3. November 2021 hat der Bundespräsident Frank-Walter Steinmeier – einem Antrag des Ministerpräsidenten von Sachsen-Anhalt Dr. Reiner Haseloff folgend – der Neurobiologin Prof. Dr. Jutta Schnitzer-Ungefug das Bundesverdienstkreuz am Bande des Verdienstordens der Bundesrepublik Deutschland verliehen. Im Rahmen der Reise des Bundespräsidenten unter dem Motto „Ortszeit Deutschland“ im Mai 2022 nach Quedlinburg in Sachsen-Anhalt gehörte Jutta Schnitzer-Ungefug zum Kreis der Persönlichkeiten, denen der Bundespräsident – in Absprache mit Ministerpräsident Haseloff – die Auszeichnung persönlich überreichte. Diese Festveranstaltung fand am 12. Mai 2022 im Rathaus Quedlinburg statt.
Im Rahmen der Ordensverleihung würdigte der Bundespräsident das Engagement von Jutta Schnitzer-Ungefug mit den Worten: „Die Neurobiologin Jutta Schnitzer-Ungefug war von 2000 bis 2020 Generalsekretärin der Nationalen Akademie der Wissenschaften Leopoldina. In ihrer Amtszeit hat sie sich insbesondere dafür eingesetzt, die Leopoldina einer breiteren Öffentlichkeit – gerade auch jungen Menschen – zu öffnen und Halle zu einem Ort gelebter Wissenschaft zu machen. Auch ehrenamtlich hat sie sich in ihrer Heimat stets engagiert, sei es beim Kinder- und Jugendtelefon Halle, als Präsidentin des Landesmusikrats und Mitglied im Demografie-Beirat Sachsen-Anhalt oder als Vorsitzende des Kuratoriums der Martin-Luther-Universität Halle-Wittenberg.“